セレスター・レキシコ・サイエンシズ株式会社（以下CLS、本社：千葉市美浜区、社長：土居洋文）と富士通株式会社（以下富士通、本社：東京都千代田区、社長：秋草直之）は、10月30日、バイオインフォマティクスを含めたハイパフォーマンスコンピューティング（以下HPC）分野全般におけるスーパーコンピュータの性能および運用性(*1)の向上に関する共同研究を開始することで合意いたしました。

HPC分野では、近年ますます大規模化する計算問題を高速かつ容易に処理するスーパーコンピュータが要求されています。特に、バイオインフォマティクス分野は、数ヶ月から1年におよぶ分子動力学法(*2)あるいは分子軌道法(*3)シミュレーションを利用したタンパク質の構造解析や、1ヶ月に1テラバイトを超える新規データが蓄積される大規模かつ多様なデータベースを利用した遺伝子・タンパク質の機能解析など、計算機システムの性能や運用性に対する要求が大変厳しい分野といえます。

本共同研究の目的は、科学・医療技術の飛躍に向けて、高性能で運用性に優れたスーパーコンピュータおよびスーパーコンピュータを利用した高性能解析システムやサービスを、CLSと富士通が協力して開発し、提供していくことです。

本共同研究により、CLSは、スーパーコンピュータの性能を十分に引き出す高性能解析システムを利用した遺伝子・タンパク質の解析サービスの提供を通じて、バイオビジネスの拡大を図ります。富士通は、より高性能で運用性に優れたスーパーコンピュータの提供を通じて、バイオインフォマティクスを含めたHPC分野全般へのスーパーコンピュータビジネスの拡大を図ります。

本共同研究では、CLSの持つ世界最高レベルのバイオインフォマティクス技術と富士通が長年にわたって培ってきた高度なHPC分野向けのノウハウやチューニング技術および製品開発技術を融合します。現在CLSにおいてマルチベンダのサーバ上で構築されている大規模ゲノム創薬システムを、富士通製スーパーコンピュータ「PRIMEPOWER HPC2500」(*4)上に統合し、このシステムを使ってPRIMEPOWERの性能および運用評価を行うことで、PRIMEPOWERの性能および運用性の向上や今後の製品開発にフィードバックします。

1. 共同研究の内容

スーパーコンピュータ上での大規模ゲノム創薬システムの構築および運用を通じて、以下の研究を共同で実施します。

(1) スーパーコンピュータの性能向上に関する研究

システムの性能評価を通じて、スーパーコンピュータのハードウェアとミドルウェアを高速化する技術、アプリケーションを最適化および並列化する技術に関する研究を行います。

(2) スーパーコンピュータの運用性向上に関する研究

システムの運用評価を通じて、スーパーコンピュータ上で最適なシステムを構築するシステム設計技術、システムを効率的かつ容易に利用し、可用性や信頼性を向上させるシステム運用技術に関する研究を行います。

2. 共同研究期間

平成14年10月30日より平成16年3月31日まで なお、上記研究期間終了時において、本共同研究の継続について協議することを予定しています。